Ở một thế giới tồn tại Kaiju, nhân loại phải thành lập các lực lượng riêng để chiến đấu với chúng. Trong số đó, Đội 3 là đội đã có chiến công tiêu diệt hàng trăm Kaiju. Tuy nhiên, câu chuyện không phải về họ mà là về người phải giải quyết bãi chiến trường nhầy nhụa mà họ để lại. Kafka Hibino là một người như thế, một chuyên viên vệ sinh xác Kaiju. Anh sống chuỗi ngày của mình với hối tiếc vì không đủ mạnh mẽ để trở thành một chiến binh như cô bạn thuở nhỏ. Đó là cho đến khi anh bị một con Kaiju chui vào mồm...